De naam Arkduif bestaat sinds 1956. In dat jaar heeft toenmalig eigenaar Van Vliet in een zelf uitgeschreven prijsvraag de naam "De Arkduif" voor deze tot dan toe naamloze molen tot winnaar uitgeroepen. 'Arkduif' verwijst naar het bijbelse verhaal van Noach in de ark, waar een duif het teken was van nieuw leven na de zondvloed.