De naam Stinksloot is niet ten onrechte. Vroeger stond daar het belangrijkste rioolgemaal van Leiden (thans een zuiveringsinstallatie). Het molenaarshuisje werd ca. 1948 gebouwd omdat molenaar Merbis min of meer de molen uitstonk!

Van de oude molen bleven voeghouten, bovenas, bovenwiel en -schijf, koningspil, onderschijf, wateras en sintelstukken van het scheprad over. Van het oorspronkelijke metselwerk bleven alleen de waterlopen en een binnenmuur over. Het oude onderwiel bleef bewaard maar werd in tweede instantie alsnog afgekeurd en vervangen.