De Zuidermolen stond zeker vanaf halverwege de zestiende eeuw op het Zuiderbolwerk, nabij de Gouw. Jacob van Deventer tekende rond 1560 de molen al in op zijn kaart van Purmerend. Er werd tarwe, rogge en mout verwerkt.
Halverwege de 17e eeuw was Sijmon Arisz. Molenaar de eigenaar.
De Zuidermolen werd in 1654 gesloopt vanwege de bouw van een nieuwe achtkante meelmolen op het Oosterbolwerk.
Bron: "Verdwenen korenmolens in Purmerend", artikel door Jack Otsen in "Nederlandse Historiën" 1995 nr. 1.