Door de aanleg van de Ringvaart van de Heerhugowaard rond 1629 werd de Zuid-Scharwouderpolder afgesneden van de bemaling van het Geestmerambacht. Bestuurlijk bleef de nieuwe polder (ruim 18 ha) tot in de 20e eeuw bij de banne Zuid-Scharwoude horen, waterstaatkundig werd het een aparte eenheid.
In de verponding van Zuid-Scharwoude van 24 februari 1731 wordt "water moolentje van den Zuijtscharwouder polder" genoemd. Op de kaart van Johannes Dou uit 1745 staat een wipmolen getekend naast de schutsluis, die voor de afvoer van tuinbouwproducten werd gebruikt.
In het kadaster 1811-1832 komt hier geen molen meer voor. Toen loosde de polder zijn water door een duiker aan de noordzijde op de molenkolk van de Panneketer gang van de Heerhugowaard, vanwaar het door diens bovenmolen werd uitgeslagen op de ringsloot. Tegenwoordig is de Zuid-Scharwouderpolder bedolven onder het industrieterrein De Zandhorst.
Bronnen:
- "De zeeweringen en waterschappen van Noordholland", Mr. G. de Vries Azn., 1864.
- Informatie van Marianne Teunis, 17 april 2010.